附属北京世纪坛医院-陈晨导师介绍
陈晨
研究员
硕，博士生导师
男
附属北京世纪坛医院
免疫学
感染免疫学,病原基因组学,生物信息学
chenchen_bj2008@163.com
陈晨，教授，研究员，博士生导师。国家科技部重点专项负责人。
2002年，本科毕业于北京大学，专修细胞遗传专业和计算机软件技术专业，是我国最早的一批生物信息研究人员。2008年，博士毕业于中国科学院基因组所，硕博连读，提前1年毕业，专业为基因组学。2009年，破格引进中国疾病预防控制中心传染病所，享受副研究员待遇，任生物信息室负责人。2015年，作为人才引进，加入首都医科大学附属北京地坛医院。
陈晨先后在中国科学院、中国疾病预防控制中心和首都医科大学附属北京地坛医院，经历包括了基础科研、公共卫生（疾控）和临床科研领域，发表SCI论文66篇，其中以第一作者和通讯作者在AIM（内科学年鉴）、LancetInfectious Diseases, Cell Metabolism，Nature Communication，Molecular Cell 和GenomeResearch等杂志发表文章48篇，单篇最高影响因子71.421，单篇最高引用超300次，总引用4640次。主持科技部重点专项1项，国家自然科学基金项目2项，国家自然基金重大项目、863重大计划、国家十二五项目子课题, 北京市科委重大项目子课题各1项。近十年从事病原变异研究，革兰氏阳性菌中四型分泌系统（被国际命名为C型四型分析系统）发现者之一。近五年，发表SCI10分以上文章8篇。
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科研项目
主要研究领域包括：
1. 病原与宿主免疫系统的共进化研究
2. 基于组学技术的病原与宿主的功能基因组学研究
3. 细菌关键生物元件在基因组中的水平转移及临床干预
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研究成果
重要学术论文 （通讯作者＊，第一作者＃）
1. Hua M#, Duan A#,Li Q#, Yue J, Liu X, Yuan L, Liu J, Chen C*. Alteration of microbiota and immune response of mice gavaged withKlebsiella oxytoca. Microbes Infect. 2022 Apr 9:104977.
2. Li NN#, Li W#,Feng JX#, Zhang WW, Zhang R, Du SH, Liu SY, Xue GH, Yan C, Cui JH,Zhao HQ, Feng YL, Gan L, Zhang Q, Chen C*, Liu D*, Yuan J*. Highalcohol-producing Klebsiella pneumoniae causes fatty liver disease through 2,3-butanediolfermentation pathway in vivo. Gut Microbes. 2021 Jan-Dec;13(1):1979883.
3. Li J#, Du P#,Yang L#, Zhang J#, Song C#, Chen D#,Song Y, Ding N, Hua M, Han K, Song R, Xie W, Chen Z, Wang X, Liu J, Xu Y, GaoG, Wang Q, Pu L, Di L, Li J, Yue J, Han J, Zhao X, Yan Y, Yu F, Wu AR, Zhang F*,Gao YQ*, Huang Y*, Wang J*, Zeng H*, Chen C*. Two-step fitness selection forintra-host variations in SARS-CoV-2. Cell Rep. 2022 Jan 11;38(2):110205.
4. Song Y#, ChenC#, Wang Y#, Zhang J#, Chen M, Gao G, Wang S,Yang D, Song R, Wang L, Xie W, Yu F, Yan L, Wang Y, Zeng H*, Zhang F*. Earlyand consecutive RT-PCR tests with both oropharyngeal swabs and sputum couldimprove testing yield for patients with COVID-19: An observation cohort studyin China. Int J Infect Dis. 2021 Jun;107:242-246.
5. Zhang J#, Ding N#, SongY#, Song R#, Pan Y#, Wang L, Yan S, Wang Q, Ma S, Wei L, Yu F, Lu L*, Zhang F*,Chen C*, Zeng H*. Phylogenomic tracing of asymptomatic transmission in aCOVID-19 outbreak. Innovation (N Y). 2021 Mar 22:100099.
6. Ju Zhang#,Nan Ding#, Lili Ren#, Rui Song#,Danying Chen#, Xuesen Zhao, Budong Chen, Junyan Han, JiaruiLi, Yangzi Song, Lin Di, Kai Han, Fengting Yu, Ruming Xie, Zhihai Chen, WenXie, Jingyuan Liu, Shan Cen, Yuhai Bi, Angela R Wu*, Fujie Zhang*,Chen Chen*, Hui Zeng*, COVID-19 reinfection in thepresence of neutralizing antibodies. National Science Review,nwab006.
7. Pengcheng Du#,Nan Ding#, Jiarui Li#, Fujie Zhang#,Qi Wang#, Zhihai Chen#, Chuan Song, KaiHan, Wen Xie, Jingyuan Liu, Linghang Wang, Lirong Wei, Shanfang Ma, Mingxi Hua,Fengting Yu, Lin Wang, Wei Wang, Kang An, Jianjun Chen, Haizhou Liu, Guiju Gao,Sa Wang, Yanyi Huang, Angela R. Wu, Jianbin Wang*, Di Liu*,Hui Zeng* & Chen Chen*. Genomicsurveillance of COVID-19 cases in Beijing. Nat Commun 11, 5503(2020).
8. Chen Chen#, Jizhou Li#, Lin Di#, Qiuyu Jing#,Pengcheng Du#, Chuan Song, Jiarui Li, Qiong Li, Yunlong Cao,X.Sunney Xie, Angela R. Wu*, Hui Zeng*, Yanyi Huang*and Jianbin Wang* . MINERVA: A Facile Strategy for SARS-CoV-2 Whole-Genome Deep Sequencing of Clinical Samples. Mol Cell. 2020 Dec17;80(6):1123-1134.e4.
9. Pengcheng Du#,Chuan Song#, Rui Li#, Yangzi Song#,Jiarui Li, Nan Ding, Ju Zhang, Rui Song, Junyan Han, Guiju Gao, Jinglin Yue,Ang Duan, Yanyi Huang, Jing An, Jianbin Wang*, Fujie Zhang*,Chen Chen*, Hui Zeng*. Specific Redistribution ofSevere Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 Variants in the RespiratorySystem and Intestinal Tract. Clinical Infectious Diseases, ciaa1617.
10. Chen Chen#, Guiju Gao#, Yanli Xu#, Lin Pu#, Qi Wang#,Liming Wang#, Wenling Wang, Yangzi Song, Meiling Chen, LinghangWang, Fengting Yu, Siyuan Yang, Yunxia Tang, Li Zhao, Huijuan Wang, Yajie Wang,Hui Zeng*, Fujie Zhang*. 2020. Sars-Cov-2–Positive Sputumand Feces after Conversion of Pharyngeal Samples in Patients with Covid-19. Annals of Internal Medicine, 2020 Jun 16;172(12):832-834.
11. Jing Yuan#,*, ChenChen#, Jinghua Cui#, Jing Lu#, ChaoYan#, Xiao Wei, Xiangna Zhao, NanNan Li, Shaoli Li, Guanhua Xue,Weiwei Cheng, Boxing Li, Huan Li, Weishi Lin, Changyu Tian, Jiangtao Zhao, JuqiangHan, Daizhi An, Qiong Zhang, Hong Wei, Minghua Zheng, Xuejun Ma, Wei Li, XiaoChen, Zheng Zhang, Hui Zeng, Sun Ying, JianXin Wu, Ruifu Yang*, DiLiu*. 2019. Fatty Liver Disease Caused by High-Alcohol-Producing Klebsiellapneumoniae. Cell Metabolism, 30(4): 675-688.e7.
12. Li J#, Du P#,Ye AY, Zhang Y, Song C, Zeng H*, Chen C*.GPA: A Microbial Genetic Polymorphisms Assignments Tool in Metagenomic Analysisby Bayesian Estimation. Genomics Proteomics Bioinformatics. 2019Feb;17(1):106-117.
13. Chen C#,*, Jiang D#, Ni M#, Li J#, Chen Z, Liu J,Ye H, Wong G, Li W, Zhang Y, Wang B, Bi Y, Chen D, Zhang P, Zhao X, Kong Y, ShiW, Du P, Xiao G, Ma J, Gao GF, Cui J, Zhang F, Liu W, Bo X, Li A*, Zeng H*, LiuD*. 2018. Phylogenomic analysis unravels evolution of yellow fever virus withinhosts. PLoS neglected tropical diseases,12(9):e0006738.
14. Du P, Zhang Y, ChenC*. 2018. Emergence of carbapenem-resistant hypervirulent Klebsiellapneumoniae. Lancet Infect Dis, 18(1):23-4.
15. Huang Y#, CaoY, Li J, Liu Y, Zhong W, Li X*, Chen C*, Hao P*. 2018. A survey oncellular RNA editing activity in response to Candida albicans infections. BMC genomics. 19(Suppl 1):43.
重要奖项
1. 序列7型猪链球菌在中国的显现、暴发和应对研究；中华预防医学会科学技术奖科技奖一等奖； 2019年
2. 序列7型猪链球菌在中国的显现、暴发和应对研究；中华医学科技奖二等奖； 2019年
重要学术任职
1. 中国医疗保健国际交流促进会分子诊断学分会 常务委员
2. 中国生物工程学会生物信息学分会 常务委员
3. 中国微生物学会微生物生物安全专业委员会 青年委员
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学校介绍
首都医科大学建校于1960年，是北京市重点高等院校，著名泌尿外科专家、中国科学院院士、中国工程院院士、原全国人大常委会副委员长吴阶平教授为首任院长。学校由校本部和附属医院(即临床医学院)组成。校本部设有基础医学院、生物医学工程学院、公共卫生与家庭医学学院、高等职业教育学院、中医药学院、顺义校区、继续教育学院、护理学院、卫生事业管理与发展学院及首都医科大学国际教学部；附属医院包括宣武医院(第一临床医学院)、附属北京友谊医院(第二临床医学院)、附属北京朝阳医院(第三临床医学院)、附属北京同仁医院(第四临床医学院)、附属北京天坛医院(第五临床医学院)、附属北京安贞医院(第六临床医学院)、附属北京口腔医院(口腔医学院)、附属北京儿童医院(儿科医学院)、附属北京妇产医院(妇产医学院)、附属北京安定医院(精神卫生学院)、附属复兴医院(第八临床医学院)、附属北京中医医院(中医药临床医学院)和康复医学院。
学校和附属医院现有教职员工和医护人员22575人。有院士4人，正高职称700余人，副高职称1800余人。学校学科专业齐全，学科力量雄厚，在基础和临床各专业拥有一大批具有很高造诣的专家学者，现有3个国家级重点学科，有38个博士学位授予权学科，58个硕士学位授予权学科和2个博士后科研流动站。
校本部和附属医院总占地面积97.3万平方米，总建筑面积134万平方米 ，固定资产总值近46.5亿元，图书馆藏书108.3万册 ，住院病床10039张。学校开办的七年制专业中设有临床医学和口腔医学；五年制专业中设有临床医学、口腔医学、预防医学、护理学、中医学等；四年制专业中设有生物医学工程、中药学和康复治疗学。在临床医学专业中设有儿科医学、康复医学、医学影像、精神卫生与精神病学和医学检验5个专业方向；在生物医学工程专业中设有医学影像设备与技术和听力学专业方向。高等职业教育设有护理、医学检验、药学、医学影像技术、康复技术、口腔修复工艺、眼科验光、实验动物技术、中医学、中药制剂、医学信息、临床医学、预防医学、中药经营贸易和中医学美容专业方向15个专业。首都医科大学现已成为以培养高层次本科生与研究生为核心、以临床应用型人才为主和培养预防、康复、生物医学工程和医学基础各学科、各层次人才，位于全国先进医学院校行列的高等学府。
学校具有较强的学术发展与科研实力，在校本部和附属医院建有一批国家级和市级重点学科和重点实验室，建有高水平的国家级或市级研究和培训机构，如卫生部全科医学培训中心、临床医学研究所、基础医学研究所、神经科学研究所、眼科研究所、老年病医疗研究中心、泌尿外科研究所、心肺血管医疗研究中心、生命科学院、卫生毒理检测中心、生物工程技术研究中心、祖国医学研究所、临床疾病研究中心、中医肝病临床研究中心、生殖医学研究所、心血管疾病临床试验及社区干预中心和北京市卫生政策与卫生经济研究中心等。神经生物学、细胞生物学、电生理学、基础免疫学、实验寄生虫学、医学图像处理、生物医学、信息检测与处理、神经内科、神经外科、心脏内外科、肾移植、呼吸和消化内科、口腔颌面外科、眼科、耳鼻咽喉科、小儿血液病等领域在国内外享有较高声誉，很多学科的研究和医疗水平已经达到或接近国际先进水平。
学校十分重视对外交流与合作，改革开放以来，先后与世界20多个国家和地区签定了友好交流协议， 近十年中,先后接待美国、加拿大、英国、澳大利亚、法国、瑞典、日本、荷兰、意大利、德国、丹麦及台湾、香港和澳门等50多个国家和地区的专家学者8000余人次来校进行学术交流和参观访问。同时，学校积极选送教师、科研人员和管理干部出国进修、参加学术会议和考察访问。
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