刘清泉教授科研团队共25人，其中，正高级职称4人，副高级职称7人、中级职称10人、初级职称4人。汇集了中西医临床、病毒细菌病原学检测、中医药流行病学调查、中医药调节机体免疫、耐药基础研究等不同领域的优秀人才，具备中医临床诊疗和基础科研条件。

[1]基于β-内酰胺酶和外膜蛋白探讨扶正透邪方对铜绿假单胞菌耐药性的作用机制，81373813，国家自然科学基金面上项目，刘清泉，2014.1-2017.12，66万元

[2]基于“祛腐生肌”理论治疗慢性皮肤溃疡的光学评价研究，61361160416，国家自然科学基金国际（地区）合作与交流项目，刘清泉，2014.1-2016.12，120万元

[3]北京市中医药传统知识调查研究，20142XA01，中医药行业科研专项，刘清泉，2014.1-2016.12，34.71万元

[4]北京市卫生系统高层次卫生技术人才学科带头人2013-2-027，北京市卫生系统高层次卫生技术人才学科带头人，刘清泉，2013.6-2016.6，90万元

[5]芪归银颗粒延缓／逆转多重耐药细菌临床前研究2013ZX09102026，国家科技重大专项，刘清泉，2013.1-2015.12，628（含匹配350）万元

[6]调和肝脾法治疗原发性失眠的多中心临床随机对照研究，Z131100006813002首都市民健康项目培育，刘清泉，2013.10-2016.9，225（含匹配75）万元

[7]北京地区流感病证特征监测及中医预警指标体系建设，Z141100006014056绿色通道，刘清泉，2014.9-2017.12，449.9717（含匹配150）万元

[8]2014年公共卫生专项资金中医临床诊疗指南应用评价项目——菌痢，SATCM-2015-BZ002，中医药标准化项目，刘清泉，2015.1-2016.6，25万元

[9]从NALP3炎性体活化/HMGB1释放研究扶正解毒通络法对脓毒症的干预效应机制，81673934，国家自然科学基金面上项目，刘清泉，2017.1-2020.12，73.2万元

[10] 突发急性传染病中医药早期临床救治体系及预案研究，2017ZX10305501国家科技重大专项，刘清泉，2017.5-2020.12，2383.57万元

[11] 芪归银方治疗重症细菌性肺炎的临床疗效及细菌耐药性研究，首发2018-1-1161，首发专项重点攻关，刘清泉，2018.1-2020.12，100万元

[12] 从Gasdermin D介导的细胞焦亡研究扶正解毒通络法对脓毒症的干预作用，7192083，北京市自然科学基金面上项目，刘清泉，2019.1-2021.12，20万元

[13] 流感病证结合中医预警体系和优化治疗方案研究，2017ZX10305501-011，国家科技重大专项，刘清泉，2019.1-2020.12，296.73万元

[14] 中国中医科学院中医药防治流感技术体系岗位科学家，岗位科学家，刘清泉，2019.8-2020.8，250万元

[15] 中医应急医疗能力提升培训班项目，应急医疗能力提升，刘清泉，2019.1-2019.12，20万元

[16] 新型冠状病毒肺炎中医诊疗方案的优化研究，Z201100005420009，创新品种及平台培育，刘清泉，2020.2-2021.2，200万元

[17] 北京地区新型冠状病毒肺炎中医证候特点及传变规律研究，YJ2020-04，新型冠状病毒肺炎防治应急科研专项，刘清泉，2020.2-2020.12，20（含匹配10）万元

[18] 中医针药联合治疗轻型及普通型新型冠状病毒肺炎前瞻性队列研究，62041701国家自然科学基金，刘清泉，2020.3-2021.3，24万元

[19] 重症及危重型新型冠状病毒肺炎标准化临床数据库建立及治疗方案真实世界研究，2020YFC0861000，重点研发计划，刘清泉，2020.9-2021.6，100万元

[20] 首都医科大学附属北京中医医院的创建与发展，WHZX-2020-69，行政事业性项目，刘清泉，2020.9-2021.7，3万元

[21] 中西医结合防治新冠病毒感染的肺炎（重症和危重症）的临床研究，2020YFC0841603，重点研发计划，刘清泉，2020.1-2021.8，100万元

[22] 脓毒症中医辨治体系和中医药治疗效果评价及优化研究，PXM2019_026273_000002，北京市财政项目，刘清泉，2017.1-2019.12，437.9804万元

[23] 基于伏邪理论的中医药治疗耐药菌感染疗效提升研究，PXM2020_026273_000001_00388644_FCG，北京市财政项目，刘清泉，2020.1-2021.12，289.7905万元

[24] 首席专家培养，首席专家人才培养经费，刘清泉，2018.5-2020.4，40万元

[25] 中医药传承与创新“百千万”人才工程（岐黄工程）岐黄学者，国家中医药管理局/院匹配，2019.3-2021.12，180万元

[26] 抗生素的中医药替代研究，中国中医科学院中医临床基础医学研究所，刘清泉，2017.2-2017.7，6万元

[27] 重污染天气下中药代茶饮干预心肺病症的疗效评价研究，横向课题，刘清泉，2018.8-2019.9，38万元

[28] 柴银颗粒治疗轻症流感的随机、双盲、阳性药平行对照研究，横向课题，，刘清泉，2019.11-2021.12，58万元

[29] 中医药替代抗生素治疗脓毒症的循证临床实践指南/专家共识，横向课题，刘清泉，2017.1-2017.6，6万元

[30] 抗病毒口服液治疗成人流感的临床应用专家共识，横向课题，刘清泉，2019.10-2020.12，24.41万元

[31] 六神丸对健康人群上呼吸道微生态变化和肠道代谢产物的干预研究，横向课题，刘清泉，2019.10-2022.03，48.3万元

[32] 柴银颗粒治疗流感的完全随机、双盲、阳性药平行对照研究，横向课题，刘清泉，2019.11-2021.11，58万

[33]从Caspase-11介导的组织因子表达和活化研究补气化瘀解毒法对脓毒症凝血功能的调节作用，82174348，国家自然科学基金，2021.01-2024.12，刘清泉，55万

[34]中医药治疗新冠肺炎临床疗效评价和机理研究创新团队, ZYYCXTD-D-202201， 国家中医药多学科交叉创新团队项目,2022.01-2024.12刘清泉，500万

[35]金花清感颗粒调控病毒性肺炎细胞因子风暴的作用机制和物质基础研究，82141202，国家自然科学基金专项项目，刘清泉，2022.01-2024.12，255万

刘清泉教授在中西医结合防治新发突发传染病领域做出了杰出的贡献。主要工作包括：（1）参与武汉新冠抗疫工作，任国家中医医疗救治专家组副组长、中共江夏方舱医院院长。参与制订国家《新型冠状病毒感染的肺炎诊疗方案》，荣获国家卫生健康委员会“全国卫生健康系统新冠肺炎疫情防控工作先进个人”称号；（2）提出“宣肺解毒法”治疗新型冠状病毒的中医用药指导理论。推出苍麻化毒颗粒和清肺丸等院内制剂，有效改善新冠患者临床表现，获“天津市科技进步一等奖”；（3）参与国家禽流感、季节性流感、甲型H1N1流感、中东流感综合征、小儿手足口病、喘证及脓毒症等重大感染性疾病的中医药诊疗指南和防治方案的制定；（4）参与优选的“金花清感方”成为世界上首个专门针对甲型H1N1流感治疗的中药有效方剂，由北京政府向广大群众推广使用。相关工作在国际顶级杂志《Annals of Internal Medicine》，获得北京市科委颁发的北京市科技进步一等奖；（5）提出以扶正透邪法的芪归银方治疗耐药菌感染，科学揭示中药作用机制，研制出具有自主知识产权的抗耐药中药制剂—芪归银颗粒；（6）牵头制定了国内第一部脓毒症中医药补充治疗指南，对中医药在重大疑难疾病的防治提供最新证据。