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现为首都儿科研究所细菌研究室副研究员，中国微生物学会临床微生物学专业委员会青年委员，医学参考报微生物学与免疫学专刊编委。2008年在韩国全南大学医科大学获得医学博士学位，后在韩国梨花女子大学纳米生物研究中心做博士后工作。2010年回国后在中国疾病预防控制中心传染病所工作，2018年调入首都儿科研究所。主要对新生儿致病菌克罗诺杆菌（原阪崎肠杆菌）分子流行病学特点；儿童腹泻常见肠道致病菌的致病机制、耐药机制；以及儿童呼吸道和肠道菌群与疾病之间相关性研究。发表文章30余篇，其中以第一作者或通讯作者在SCI上发表论文15篇。国家重点研发项目子课题负责人，国家自然基金面上、青年项目项目负责人和国家自然基金重点项目，国家艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治科技重大专项的项目骨干成岩。获得国家专利6项。参编论著1部。
序号 | 项目名称 | 来源 | 级别 | 经费 | 起止时间 | 项目中角色（主持/参与） |
1 | 重要致病菌流行病学特征分析及mRNA疫苗免疫原设计 | 国家科技部 | 国家级 | 100万元 | 2025.5-2028.4 | 主持 |
2 | 高产乙醇肺炎克雷伯杆菌导致内源性乙醇介导的造血干细胞DNA损伤及调控机制的研究 | 国家自然基金委 | 国家级 | 52万元 | 2023.1-2026.12 | 主持 |
3 | 儿童肺部菌群与呼吸道过敏性疾病相关性研究 | 首都儿科研究所 | 所级 | 30万元 | 2023.1-2025.12 | 主持 |
4 | 高产乙醇肺炎克雷伯杆菌诱导小鼠肺部感染的致病机制 | 首都儿科研究所 | 所级 | 5万元 | 2021.1-2022.1 | 主持 |
5 | NAFLD的“内源性酒精性脂肪肝病”特征菌群谱及新诊疗策略的研究 | 国家自然基金委 | 国家级 | 290万元 | 2022.1-2026.12 | 参与，课题骨干 |
6 | 肠道菌HiAlc Kpn内源性乙醇诱导肥胖儿童NAFLD机制研究 | 北京市自然基金委 | 省部级 | 20万元 | 2022.1-2024.12 | 参与，课题骨干 |
1. Cui J, Xu Z, Yu Z, Zhang Q, Liu S, Du B, Gan L, Yan C, Xue G, Feng J, Fan Z, Fu T, Feng Y, Zhao H, Ding Z, Li X, Zhang R, Cui X, Tian Z, Huang K, Wang W, Bai Y, Zhou H, Sun Y, Yang X, Wan M, Ke Y, Yuan J. High-alcohol-producing Klebsiella pneumoniae aggravates lung injury by affecting neutrophils and the airway epithelium.Cell Rep Med. 2025 Jan 21;6(1):101886
2. Cui J, Zhang Y, Li X, Ding Z, Kong Y, Yu Z, Li Z, Tong J, Liu Z, Yuan J. Antimicrobial resistance profiles and genome characteristics of Klebsiella isolated from the faeces of neonates in the neonatal intensive care unit. J Med Microbiol. 2024 Aug;73(8):001862.
3. Cui J, Li X, Zhang Q, Du B, Ding Z, Yan C, Xue G, Gan L, Feng J, Fan Z, Xu Z, Yu Z, Fu T, Feng Y, Zhao H, Kong Y, Cui X, Tian Z, Liu Q, Yuan J. Existence and distribution of the microbiome in tumour tissues of children with hepatoblastoma.Heliyon. 2024 Oct 18;10(21):e39547.
4. Cui J, Zhang Y, Zhao H, Sun X, Chen Z, Zhang Q, Yan C, Xue G, Li S, Feng Y, Liu H, Xie X, Yuan J. The Relationship Between Lower Respiratory Tract Microbiome and Allergic Respiratory Tract Diseases in Children. Front Microbiol. 2021 May 14;12:630345.
5. Cui J, Hu J, Du X, Yan C, Xue G, Li S, Cui Z, Huang H, Yuan J. Genomic Analysis of Putative Virulence Factors Affecting Cytotoxicity of Cronobacter. Front Microbiol. 2020 Feb 7;10:3104.
6. Ding Z, Cui J, Zhang Q, Feng J, Du B, Xue G, Yan C, Gan L, Fan Z, Feng Y, Zhao H, Xu Z, Yu Z, Fu T, Zhang R, Cui X, Tian Z, Chen J, Chen Y, Li Z, Zhong X, Lin Y, Yuan J. Detecting and quantifying Veillonella by real-time quantitative PCR and droplet digital PCR.
Appl Microbiol Biotechnol. 2024 Dec;108(1):45.
7.Jin M, Cui J, Ning H, Wang M, Liu W, Yao K, Yuan J, Zhong X. Alterations in gut microbiota and metabolite profiles in patients with infantile cholestasis. BMC Microbiol. 2023 Nov 18;23(1):357.
8.Yan C, Cui J, Huang L, Du B, Chen L, Xue G, Li S, Zhang W, Zhao L, Sun Y, Yao H, Li N, Zhao H, Feng Y, Liu S, Zhang Q, Liu D, Yuan J. Rapid and visual detection of 2019 of novel coronavirus (SARS-CoV-2) by a reverse transcription loop-mediated isothermal amplification assay. Clin Microbiol Infect. 2020 Jun;26(6):773-779.
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