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李佳瑞，博士毕业于北京大学，生物信息学专业。围绕“病原在宿主内的异质性”展开研究，以低频突变的检出和生物信息学分析为切入点，在技术、理论和应用三个层面取得显著进展。技术上，通过区域化富集建库和优化贝叶斯算法，成功将低频突变的检出率和精度提升10倍；理论上，引入隐变量和迭代相关的贝叶斯算法，实现病原基因组识别从“种”到“株”的升级；应用方面，将方法用于COVID-19研究，提出了病毒“两步进化”理论，即早期正选择导致蛋白改变的积累，为后期负选择提供重要储存库。该理论首次揭示了正选择推动的新冠病毒的快速演化，预测了免疫逃逸位点，并在后期Delta和Omicron病毒株中得到验证，为疫情防控提供了关键理论依据。先后主持国家自然科学基金青年基金、北京市医管中心“青苗”人才计划等项目；以第一或通讯作者在Nature Communications、Microbiome、Cell Reports等国际同行评议期刊发表论文多篇。
1. 国家自然科学基金青年基金 基于单分子共编码测序技术的临床呼吸道样本多重耐药菌精准识别体系研究
2. 北京市医管中心“青苗”人才计划 二代测序联合贝叶斯算法开展ICU肺炎克雷伯菌体内溯源方法研究
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