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张聚,副研究员、副教授,首医青年学者,绿通博导,具有医学、功能基因组学与分子生物学的多学科交叉背景。本科就读于山东大学医学院临床医学专业;研究生毕业于中国科学院研究生院,在北京基因组研究所完成研究工作。先后任职于中国科学院北京基因组研究所、北京地坛医院传染病研究所、北京世纪坛医院生物医学创新中心,期间一直利用高通量测序技术与质谱技术,开展感染免疫学和功能多组学的相关研究。近年来专注于固有免疫记忆研究和免疫调节药物开发工作,利用 3D 基因组、表观基因组、代谢组等技术手段,探索免疫调节机制、寻找药物靶点。发表第一作者和通讯作者(含共同)研究性论文16篇,其中中科院一区论文5篇、二区5篇,总影响因子136.4,单篇最高影响因子32.1。发表在Natl Sci Rev的论文,在该杂志当年发表文章中影响力排名第6位,获得“第十六届北京青年优秀科技论文”。
本团队是细胞免疫学、分子生物学、药理学、功能多组学与生物信息学领域的跨学科复合型团队,由研究员、技术员和学生共同构成,人员结构合理。团队始终践行"科学问题驱动、技术创新引领、合作沟通互促"的团队理念,提倡严谨务实的学术态度、开放协同的学术氛围及阶梯式成长支持。
北京市自然科学基金面上项目:调控肺炎克雷伯菌持留性的基因组甲基化相变研究,批准号:7242080,2024-01 至 2026-12,20万元,在研,主持
1. 科技部国家重点研发计划项目:2019-nCoV溯源和传播途径研究,批准号:2020YFC0840800,2020-01 至 2021-12,1100万元,结题,子项目负责人
2. 国家自然科学基金青年科学基金项目:BAG2经由未折叠蛋白质应答信号网络诱导结肠癌细胞老化的作用机制研究,批准号:31401172,2015-01 至 2017-12,24万元,结题,主持
3. 北京市自然科学基金面上项目:调控肺炎克雷伯菌持留性的基因组甲基化相变研究,批准号:7242080,2024-01 至 2026-12,20万元,在研,主持
4. 科技部国家重点研发计划项目:2019-nCoV序列动态变化监测技术和基因组溯源分析, 批准号:2020YFC0840900,2020-01 至 2021-12,240万元,结题,参与
5. 基金委国家自然科学基金面上项目:基于多组学分析的绿脓杆菌新耐药机制——持留菌的分子网络研究,批准号:31570133,2016-01 至 2019-12,72.2万元,结题,参与
6. 国家自然科学基金重大研究计划项目:小鼠 AOM 结直肠癌模型的微进化研究,批准号:91131009,2012-01 至 2014-12,120万元,结题,参与
重要学术论文:
1. Zhang J#*, Tong S#, Liang, S#, Li F, Zhang C, Ding N, Hao Y*. ATAC-seq library preparation of murine bone marrow-derived neutrophils. J Vis Exp. 2025, 215:e67490.
2. Hao Y#*, Zhang C#, Li F, Fan Y, Chi K, Zeng H, Zhang J*. Protocol for identifying stressed granulocytes from septic mice. STAR Protoc. 2024, 5:102958.
3. Deng J#, Zhang J#, Meng S, Ding N, Hao Y, Zeng H*, Lin J*. LDLR c.89_92dup: a novel frameshift variation in familial hypercholesterolemia. Lipids Health Dis. 2024, 23:182.
4. Wang B#, Zhu L#, Jia B#, Zhao C#, Zhang J#, Li F, Li J, Ding N, Zhang C, Hao Y, Tong S, Wang J, Li G, Fan Y,Zhang H, Li R, Du J, Kong Y, Zhang Y, Yang X, Han J, Yu Z, Du Z, Zheng H, Christian Kosan, Li A, Chen C, MaY*, Zeng H*. Sepsis induces non-classic innate immune memory in granulocytes. Cell Rep. 2023, 42:113044.
5. Fu J#, Zhang J#, Yang L#, Ding N#, Yue L#, Zhang X, Lu D, Jia X, Li C, Guo C, Yin Z, Jiang X, Zhao Y, ChenF*, Zhou D*. Precision Methylome and in vivo Methylation Kinetics Characterization of Klebsiella Pneumoniae.Genomics Proteomics Bioinformatics. 2022, 20:418-434.
6. Li J#, Du P#, Yang L#, Zhang J#, Song C#, Chen D#, Song Y, Ding N, Hua M, Han K, Song R, Xie W, Chen Z,Wang X, Liu J, Xu Y, Gao G, Wang Q, Pu L, Di L, Li J, Yue J, Han J, Zhao X, Yan Y, Yu F, Wu AR, Zhang F*, GaoYQ*, Huang Y*, Wang J*, Zeng H*, Chen C*. Two-step fitness selection for intra-host variations in SARS-CoV2. Cell Rep. 2022, 38:110205.
7. Zhang J#, Ding N#, Ren L#, Song R#, Chen D#, Zhao X, Chen B, Han J, Li J, Song Y, Di L, Han K, Yu F, Xie R,Chen Z, Xie W, Liu J, Cen S, Bi Y, Wu AR*, Zhang F*, Chen C*, Zeng H*. COVID-19 reinfection in the presenceof neutralizing antibodies. Natl Sci Rev. 2021, 8:nwab006.
8. Zhang J#, Ding N#, Song Y#, Song R#, Pan Y#, Wang L, Yan S, Wang Q, Ma S, Wei L, Yu F, Lu L, Zhang F*, Chen C*, Zeng H*. Phylogenomic tracing of asymptomatic transmission in a COVID-19 outbreak. Innovation (N Y). 2021,2:100099.
9. Zhu L#, Zhang J#, Zhang Y,Lang J, Xiang J, Bai X, Yan N, Tian G, Zhang H*, Yang J*.NAIGO: an improved method to align PPI networks based on gene ontology and graphlets.Front Bioeng Biotechnol. 2020, 8:547.
重要奖项:
北京市科学技术协会 第十六届北京青年优秀科技论文 202201
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