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博士毕业于清华大学自动化系、北京信息科学与技术国家研究中心生物信息学研究部。作为联合培养博士生在加州大学旧金山分校系统生物学实验室（2013年9月至2014年7月）和斯坦福大学生物工程学院（2014年8月至2014年9月）进行了一年的交流学习，研究方向为生物信息学算法、大数据分析。
目前科研方向为医疗大模型、生物医学信息学、医学大数据分析、医学自然语言处理。具有深厚的交叉学科背景，对医疗健康大数据分析，疾病辅助诊断模型方向有系统的研究。近年来以第一作者或通讯作者的身份在生物医学信息学领域的TOP杂志发表科研论文多篇，主持国家自然科学基金青年课题、北京市自然科学基金面上课题、北京市教委优秀青年人才培育计划、北京市优秀人才青年骨干个人等课题。2022年获首都医科大学青年教学奖。
个人主持：
国家自然科学基金 2018-2020 基于深度学习的肝癌影像学报告辅助诊断模型研究
北京市优秀人才青年骨干个人项目 2018-2020
首都医科大学自然科研基金 2021年、2022年
北京市教委优秀青年培育计划 2023-2025
北京市教委科技计划面上项目 2023-2025 面向疾病医疗文本的动态知识图谱构建关键技术研究
北京市自然科学基金面上项目 2024-2026
参与863科研计划等。
主持国家自然科学基金青年课题、北京市自然科学基金面上课题、北京市教委科研计划面上项目、北京市教委优秀青年人才培育计划、北京市优秀人才青年骨干个人等项目
重要学术论文
1). Kan Wang, Binyu Gao, Heqi Liu, Hui Chen, Honglei Liu*, The real-time andpatient-specific prediction for duration and recovery profile of cisatracuriumbased on deep learning models. Frontiers in Pharmacology. 2022. 12.
2). Ni Wang, Muyu Wang, Xin Xin, Tong Zhang, HaoWu, Xiaojie Huang* and Honglei Liu*,Exploring the Relationship between Anxiety, Depression, and Sleep Disturbanceamong HIV Patients in China from a Network Perspective. Frontiers in Psychiatry. 2021. 12: 1814.
3). HongleiLiu, Zhiqiang Zhang,Yan Xu, Ni Wang, Yanqun Huang, Zhanghan Yang, RuiJiang, Hui Chen. Use of BERT (Bidirectional Encoder Representations fromTransformers)-Based Deep Learning Method for Extracting Evidences in ChineseRadiology Reports: Development of a Computer-Aided Liver Cancer DiagnosisFramework. Journal of Medical InternetResearch. 2021;23(1):e19689.
4). HongleiLiu, Yan Xu, Zhiqiang Zhang, Ni Wang, Yanqun Huang, Yanjun Hu, ZhanghanYang, Rui Jiang *, Hui Chen *. A Natural Language Processing Pipeline ofChinese Free-text Radiology Reports for Liver Cancer Diagnosis. IEEE ACCESS, 2020, 8(2020): 159110-9.
5). HongleiLiu #, Ni Wang #, Wei Chen, Wenyan Liu, Shiping Wang, Jianbo Lei *, HuiChen *, Hospitalization Trends in Adult Patients with COPD and Other RespiratoryDiseases in Northeast China from 2005 to 2015, Biomed Research International, 2018(2018):1-7.
6). HongleiLiu, Xiaowo, Wang, Lei, Qi, Using CRISPR-ERA Webserver for sgRNA Design, BIO-PROTOCOL, 2017, 7(17).
7). Honglei Liu, Zheng Wei, Antonia Dominguez，Yanda Li,Xiaowo Wang*, Lei S Qi*. CRISPR-ERA: a comprehensive design tool forCRISPR-mediated gene editing, repression and activation. Bioinformatics. 2015;31(22):3676-3678.
重要奖项
首都医科大学青年教学奖 2022年
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