肿瘤研究中心实验室现有基因表达与表观调控、蛋白及其修饰、抗体构建与免疫检测、循环肿瘤细胞及其核酸鉴定、患者源性肿瘤异种移植模型动物、生物样本库与生信数据处理等多个特色研究平台，拥有包括多光谱全自动高级切片分析系统、自动化核酸提取工作站、生物分子相互作用分析仪、全自动免疫细胞裂解洗涤仪、小动物活体光学3D成像系统、多肽合成仪、Thermo Fischer ArrayScan^TM 细胞学研究高内涵分析系统、液相芯片监测系统、激光捕获显微切割系统、循环肿瘤细胞检测系统、全自动芯片扫描系统、液相色谱质谱联用仪和蛋白质分离层析纯化系统等全套大型、精密科研实验仪器100多台（件）、设备总值4000万元。研究团队专注于肺癌肿瘤微环境与免疫治疗转化研究。

        研究团队包括工作人员16人，其中博士研究生学历人员9人，硕士研究生学历1人，技术支持6人。每年招收博士1-2名，硕士2-3名。现有在读博士研究生7名，硕士研究生16名。

        科研对外合作方面，与北京大学医学部、清华大学、军事医学研究院、中科院和美国Mayo Clinic等国内外大学机构保持长期的密切合作。目前科室着力打造团结、高效的科研团队。

一，在研究方面，作为第一完成人首次阐明了泛素类似蛋白NEDD8参与DNA损伤修复应答及肿瘤发生的分子机理，解决了本领域10多年悬而未决的谜团。该发现被国际同行誉为该领域的重大突破，发表在国际顶级刊物Molecular Cell杂志上，并被Faculty of 1000网站推荐为必读论文。著名的综述杂志Nature Reviews of Molecular Cell Biology， Trends in Cell Biology也对本论文进行了正面他引和综合评述。

二，在转化应用方面，首次提出了Neddylation通路可以作为肿瘤治疗的靶标，发现顺铂和Neddylation通路抑制剂MLN4924的联合应用可以更有效增强顺铂的杀伤卵巢癌细胞作用，对于减轻肿瘤细胞对顺铂类药物耐药性具有重要的临床意义。该研究2013年被美国最大的私人卵巢癌研究基金OCRF授予7.5万美元的后续研究资助（当年该基金在全美只有6人获得）。进一步与北京大学第三医院生殖医学中心合作研究发现了Neddylation通路调节卵母细胞成熟发育，发表于Cell Cycle杂志，为临床治疗相关疾病提供了新的理论基础。

三，关于DNA双链断裂同源重组修复研究相关成果

DNA双链断裂（DSB）的末端切除形成3'单链DNA（ssDNA）对于启动DSB修复的同源重组（HR）途径至关重要。由于缺乏同源DNA作为模板，HR通路在G1期细胞中受到严格限制。核酸外切酶1（EXO1）是负责DSB末端切除的3'ssDNA形成的关键分子。我们发现，EXO1通过泛素介导的降解在G1期细胞中失活，这是由于RBX1蛋白在G1期的表达水平升高所致。 RBX1的增加显著促进了Cullin1的neddylation修饰，并促进了EXO1的G1期特异性降解。 RPA32，BrdU和Rad51 foci形成的增加证明了RBX1的抑制显著减弱了EXO1的降解，并增加了经γ射线照射的G1期细胞的末端切除和HR活性。 EXO1耗尽可减轻由于RBX1减少而引起的DNA修复缺陷。此外，发现在S2056处DNA-PKcs的自磷酸化增加是RBX1在G1期较高表达水平的原因。 DNA-PKcs的失活降低了RBX1的表达，同时增加了G1期细胞中EXO1的表达和DSB末端切除。这项研究证明了通过RBX1促使EXO1失活来抑制G1期DNA DSB修复的HR途径的新机制。相关成果发表于Cell Death and Differentiation杂志 （PMID 31562368）。该研究对于了解DNA双链断裂修复通路选择的分子机制具有重要的科学价值。

四，同源重组修复与小细胞肺癌免疫微环境研究相关成果

HR修复中的同源DNA配对和链侵入过程与SCLC患者的整体免疫状况呈负相关。Rad51蛋白在DNA配对和链侵入环节发挥核心作用。用Rad51抑制剂处理SCLC细胞增加了重要免疫检查点分子的表达，并且促进SCLC患者PBMC细胞迁移。相关成果发表于Molecular Cancer杂志 （PMID 34620176）。因此，我们的研究结果将揭示SCLC的肿瘤微环境中重要DNA损伤修复分子对免疫微环境的负调控，为阐明SCLC免疫抑制的分子机制并寻求治疗新靶点提供重要的理论和实验基础。

五，此外， 还作为主要完成人之一，参与研究多项关于长链非编码RNA的研究。例如关于长链非编码RNA DSCAM-AS1在乳腺癌Tomaxifen耐药机制的研究，研究成果发表于Nature Communications杂志。关于长链非编码RNA PCAT-1调节BRCA2影响同源重组修复的研究，发表于Cancer Research杂志。通过染色体RNA免疫沉淀发现长链非编码RNA SCHLAP1与SWI/SNF复合体相互作用，调节前列腺癌进展和转移，发表于Nature Genetics杂志。

(1) 国家自然科学基金委，面上项目，82273130，DNA-PKcs与RNF168相互作用调节DNA损伤修复及小细胞肺癌化疗耐药的作用和机制研究，2023-01至2026-12，在研，主持

(2) 希思科—恒瑞肿瘤研究基金项目，面上项目，Y-HR2020MS-0156，基于纳米技术动态监测小细胞肺癌免疫治疗的方法，2022-09至2024-09，在研，主持

(3) 国家自然科学基金委，青年项目，81602799，类泛素化neddylation修饰对HR和NHEJ修复关键蛋白的调节，2017-01至2019-12，已结题，主持

(4) 国家自然科学基金委，面上项目，31570853，组蛋白类泛素化neddylation修饰在DNA损伤修复中的作用及分子机制，2016-01至2019-12，已结题，主持

(5) 美国卵巢癌基金会 Ann Schreiber Grant ：The analysis of NEDD8-Activating Enzymeinhibitor MLN4924 on ovarian cancer ，2013-3至2014-2，已结题，主持

近五年代表性论文 (#共同一作；*通讯作者）

(1) Zhuohong Yan , Chunmao Wang,  Jinghong Wu, Jinghui Wang, Teng Ma*. TIM-3 teams up with PD-1 in cancer immunotherapy: mechanisms and perspectives. Molecular Biomedicine. 2025, 6(1):27. 

(2) Zihui Guan, Zhengqi Zhang, Kaiyan Wang, Shukai Qiao, Teng Ma*, Lina Wu*.. Targeting myeloid cells for hematological malignancies: the present and future. Biomarker Research. 2025, 13(1):59. 

(3) Jiabao Hou, Mingjun Lu, Jingwei Guo, Jinghong Wu, Chenyang Wang, Ping-Kun Zhou*, Teng Ma*. DNA-PKcs, a player winding and dancing with RNA metabolism and diseases. Cellular & Molecular Biology Letters. 2025, 30(1):25.

(4) Mingjun Lu#, Jinghong Wu#, Qing Gao, Renjing Jin, Changming An*, Teng Ma*. To cleave or not and how? The DNA exonucleases and endonucleases in immunity. Genes and Diseases. 2025, 12(2):101219.

(5) Jinghong Wu, Liwei Song, Mingjun Lu, Qing Gao, Shaofa Xu, Ping-Kun Zhou*, Teng Ma*, The multifaceted functions of DNA-PKcs: implications for the therapy of human diseases. MedComm (2020). 2024, 5(7):e613.

(6) Qing Gao, Luyu Yang, Mingjun Lu, Renjing Jin, Huan Ye and Teng Ma*. The artificial intelligence and machine learning in lung cancer immunotherapy. Journal of Hematology and Oncology. 2023, 16(1):55.

(7)  Renjing Jin#, Bin Liu #, Mengjun Yu, Liwei Song, Meng Gu, Ziyu Wang, Xiaobo Li, Xu Zhang, Jinghui Wang, Teng Ma*. Profiling of DNA damage and repair pathways in small cell lung cancer reveals a suppressive role in the immune landscape. Molecular Cancer. 2021, 20(1):130.

(8)  Renjing Jin#, Xiaoqing Cao#, Mingjun Lu, Qing Gao, Teng Ma*. The intersection molecule MDA5 in cancer and COVID-19. Frontiers in immunology. 2022, DOI 10.3389/fimmu.2022.963051  .

(9)  Hang Song #, Jianye Zhang*, Bin Liu#, Jing Xu, Biao Cai, Hai Yange, Julia Straube, Xiyong Yu*, Teng Ma*. Biological Roles of RNA m5C Modification and its implications in Cancer Immunotherapy. Biomarker Research. 2022,10(1):15.

(10)  Zongpei Guo; Shaozheng Wang; Ying Xie; Yang Han; Sai Hu; Hua Guan; Dafei Xie; Chenjun Bai; Xiaodan Liu; Yongqing Gu; Ping-Kun Zhou*; Teng Ma*. HUWE1-dependent DNA-PKcs neddylation modulates its autophosphorylation in DNA damage response. Cell Death & Disease, 2020,11:400.

(11)  Ying Xie#; Yi-ke Liu#; Zong-Pei Guo; Hua Guan; Xiao-Dan Liu; Da-Fei Xie; Yi-Guo Jiang; Teng Ma*; Ping-Kun Zhou*. RBX1 prompts degradation of EXO1 to limit the homologous recombination pathway of DNA double-strand break repair in G1 phase, Cell Death and Differentiation, 2020, 27：1383-1397. 

(12)  Zhiquan Song#; Ying Xie#; Zongpei Guo; Yang Han; Hua Guan; Xiaodan Liu; Teng Ma*; Ping-Kun Zhou*. Genome-wide identification of DNA-PKcs-associated RNAs by RIP-Seq, Signal Transduction And Targeted Therapy, 2019, 4：22.