国家自然科学基金面上项目： 线粒体DNA 6mA 甲基化调控小鼠胚胎干细胞自我更新和分化的功能研究， 32270627， 2023.01-2026.12

      细胞的生命过程是基因信息次序表达的结果。在此基础上的表观遗传修饰则赋予了生命体呈现更加千姿百态的变化。表观遗传修饰对DNA/RNA承载的遗传信息的精细调控确保了生命程式稳定，有序的运行。研究表观遗传信息的建立与维持对深入了解细胞发育以及人类疾病如癌症、神经退行性疾病、自身免疫性疾病，代谢性疾病等致病机制具有重要的意义。本课题组致力于运用化学生物学、表观遗传学、核酸化学等多学科手段探索DNA/RNA修饰在复杂生命体系中的生物学功能和调控机制，发展DNA/RNA修饰及染色质可及性的表征测定方法，关注核酸修饰在疾病诊断与治疗当中的应用。同时，我们致力于开发体内关键核酸代谢物的生物传感器，运用合成生物学手段及基因编辑技术发展时空可控的DNA/RNA表观遗传编辑工具。主要研究方向如下：

      (1) 核酸修饰在肿瘤发生发展的生物学功能及调控机制研究；

      (2) 发展RNA修饰及染色质可及性的检测技术；

      (3) 体内关键核酸代谢物的生物传感器开发；

      (4) 时空可控的表观遗传基因编辑工具开发。

1. Hao Z.#, Wu T.#, Cui X., Zhu P., Tan C., Dou X., Hsu K, Lin Y, Peng P, Gao Y., Zang L., Hu L., Sun H, Liu J., Wu K, He C. “N6-deoxyadenosine Methylation in Mammalian Mitochondrial DNA”, Mol. Cell, 2020,78:382-295. [Highlighted in Nature Reviews Molecular Cell Biology]

2. Luo G.#, Hao Z.#, Shen  M.,  Sparvoli  D,  Zheng  Y, Zhang  Z,  Weng  X,  Chen  K, Cui Q, Turkewitz A, He C, “N6-methyldeoxyadenosine directs nucleosome positioning in eukaryotic DNA”, Genome Biol., 2018, 19:200.

3. Hao Z., Zhu R., Peng C, “Genetically encoded fluorescent sensors for measuring transition and heavy metals in biological systems”, Curr. Opin. Chem. Biol., 2017 43:87-96

4. Zhu R.#, Hao Z.#, Lou H., Song Y., Zhao J., Chen Y., Zhu J., Chen P. “Structural and mechanistic study of the cysteine oxidation-mediated induction of the Escherichia. Coli MarR regulator”. Tetrahedron, 2017, 73:3714-3719.

5. Hao Z.#, Lou H.#, Zhu R., Zhu J., Zhang D., Zhao B., Zeng S., Chen X., Chan J., He C* and Chen P*. “The multiple antibiotic resistance regulator MarR is a copper sensor in Escherichia coli”, Nat. Chem. Biol., 2014, 10:21-8. [Recommended by Faculty of 1000, highlighted in Chemistry World]

6. Hao Z., Hong S., Chen X, Chen P. “Introducing bioorthogonal functionalities into proteins in living cells”, Acc. Chem. Res., 2011, 44:742-51.

7. Hao Z., Song Y., Lin S., Yang M., Liang Y., Wang J. and Chen P. “A readily synthesized cyclic pyrrolysine analogue for site-specific protein ‘click’ labeling”, Chem. Commun., 2011, 47: 4502-4504.