童朝晖教授课题组致力于呼吸系统危重症、感染及间质性疾病的临床和基础研究，团队主要的研究方向包括：

1、急性呼吸窘迫综合征（ARDS）临床诊治策略优化及机制研究；

2、呼吸系统感染性疾病的多组学分析及宿主抗感染机制的研究；

3、间质性肺疾病的分子机制研究及治疗靶点研发。

在研项目：

1. 慢病人群呼吸机依赖的高危因素及适宜干预策略研究（科技部-科技创新2030重大专项，2024ZD0530005），245万，2025/2/1-2029/1/31，主持

2. 重症肺炎免疫动态全景研究及早期诊断与预后预测模型开发（2025年北京市重大呼吸道传染病项目，BJRID2025-011），100万，2025/1/1-2025/12/31，主持

3. 呼吸系统感染免疫学联合实验室（首都医科大学基础-临床联合实验室），150万，2025/1/1-2027/12/31，主持

4. 医学高层次人才计划（国家杰出医师），60万，主持

5. 肠道微生态在肺动脉高压相关呼吸疾病中的作用与机制（北京市呼吸疾病研究所，Ysbz2025004），414.4万，2025/1/1-2026/1/1，主持

6. 肺孢子菌肺炎中IL-10通过CD8+T细胞糖酵解重塑其免疫活性的分子机制研究（国家自然科学基金，82270009），2023/1-2026/12，53万，主持

• 重要学术论文：
• 1. Gao R, Chu H, Gu Y, Yang H, Li H, Sun B, Tong Z, Xu L. Application of Bronchoscopic Intervention in Pulmonary Mucormycosis. Am J Respir Crit Care Med. 2025 Jun;211(6):1069-1071. 
• 2. Chen Y, Chen Z, Liang L, Li J, Meng L, Yuan W, Xie B, Zhang X, Feng L, Jia Y, Fu Z, Su P, Tong Z, Zhong J, Liu X. Multi kingdom gut microbiota dysbiosis is associated with the development of pulmonary arterial hypertension. EBioMedicine. 2025 May;115:105686. 
• 3. Yang H, Guan L, Xue Y, Li X, Gao L, Zhang Z, Zhang H, Ma H, Liu F, Huang X, Tong Z, Li J. Longitudinal multi-omics analysis of convalescent individuals with respiratory sequelae 6-36 months after COVID-19. BMC Med. 2025 Mar 5;23(1):134.
• 4.Wang F, Yang B, Zhang X, Subinuer K, Li W, Rong H, Tong Z. Comparative study of bronchoscopic and CTguided percutaneous microwave ablation for inoperable non-small cell lung cancer. Transl Lung Cancer Res. 2025 Sep 30;14(9):3529-3541.
• 5. Yang H, Gao L, Xue Y, Zhang Z, Guan L, Zhang H, Ma H, Li X, Li J, Tong Z. Clinical Characteristics and Treatment Efficacy in Patients With SARS-CoV-2 Positivity After Nirmatrelvir-Ritonavir Therapy. J Med Virol. 2025 May;97(5):e70377.
• 6. Gu X, Kang H, Cao S, Tong Z, Song N. Blockade of TREM2 ameliorates pulmonary inflammation and fibrosis by modulating sphingolipid metabolism. Transl Res. 2025 Jan;275:1-17. 
• 7. Chen Y, Zhang X, Chen Y, Tong Z. Assessment of bidirectional relationships between frailty and acute respiratory distress syndrome: a bidirectional Mendelian Randomization study. BMC Geriatr. 2024 Nov 29;24(1):981.
• 8. Kang H, Gu X, Cao S, Tong Z, Song N. Integrated multi-omics analyses reveal the pro-inflammatory and pro-fibrotic pulmonary macrophage subcluster in silicosis. Ecotoxicol Environ Saf. 2024 Oct 1;284:116899. 
• 9. Luo L, Li Y, Wang L, Sun B, Tong Z. Ultrasound evaluation of cardiac and diaphragmatic function at different positions during a spontaneous breathing trial predicting extubation outcomes: a retrospective cohort study. BMC Med Imaging. 2024 Aug 15;24(1):217. 
• 10. Zhang X, Shao S, Song N, Yang B, Liu F, Tong Z, Wang F, Li J. Integrated omics characterization reveals reduced cancer indicators and elevated inflammatory factors after thermal ablation in non-small cell lung cancer patients. Respir Res. 2024 Aug 14;25(1):309.
• 11. Liu F, Yang H, Yang T, Zhang Z, Guan L, Gao L, Ma H, Zhang H, Song N, Tong Z, Li J. Dysregulated proteasome activity and steroid hormone biosynthesis are associated with mortality among patients with acute COVID-19. J Transl Med. 2024 Jul 4;22(1):626. 
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• 19. Hui Yang, Zhaojian Wang, Chunguo Jiang, Yi Zhang, Ying Zhang, Man Xu, Yi Zhang, Yushu Wang, Xuefeng Liu, Zhuoling An*, Zhaohui Tong*..Oral azvudine for mild-to-moderate COVID-19 in high risk, nonhospitalized adults: Results of a real-world study.J Med Virol.2023.95(7).e28947.SCI(含SCIE)
• 20. Zhijin Zhang, Shuai Shao, Xuefeng Liu, Zhaohui Tong*.Effect and safety of mesenchymal stem cells for patients with COVID-19: Systematic review and meta-analysis with trial sequential analysis..J Med Virol.2023.95(4).e28702.SCI(含SCIE)
• 21. Yawen Wang, Kang Li , Weichao Zhao, Yalan Liu, Ting Li, Hu-Qin Yang, Zhaohui Tong*, Nan Song*.Integrated multi-omics analyses reveal the altered transcriptomic characteristics of pulmonary macrophages in immunocompromised hosts with Pneumocystis pneumonia..Front Immunol.2023.14.1179094.SCI(含SCIE)
• 22. Lirong Liang, Yingxiang Lin, Lin Feng, Shuai Shao, Siyu Cao, Hengmo Rong, Shuilian Chu, Wuxiang Xie Samuel Cai, Jiawen Wang, Zhaohui Tong*.Multicentre double-blind randomised controlled trial of systematic corticosteroid therapy in patients with acute exacerbations of chronic obstructive pulmonary disease admitted to hospital with higher eosinophil levels: the ECHO protocol..BMJ Open.2023.13(5).e066354.SCI(含SCIE)
• 23. Wang F, Zhou L, Wang Z, Xu L, Wu Y, Li X, Qiu X, Zhao S, Zheng Y, Jiang Z, Shi H, Tong Z*.Autofluorescence imaging-assisted medical thoracoscopy in the diagnosis of malignant pleural disease..Respir Med.2023.207.107114.SCI(含SCIE)
• 24. Zhao W, Zhu M, Wang R, Tong Z*.Pemetrexed long-term maintenance therapy for advanced severe lung cancer with long-term progression-free survival: a case report..Anticancer Drugs.2023.34(5).686-689.SCI(含SCIE)
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• 27. Dan Ma, Qian-Yu Zhang, Heng-Mo Rong, Kan Zhai, and Zhao-Hui Tong*.Proteomic Profiling and Functional Analysis of B Cell-Derived Exosomes upon Pneumocystis Infection.Journal of Immunology Research.2022.Volume 2022.15.SCI(含SCIE)
• 28. Wang H, Zhang C, Zhang C, Wang Y, Zhai K, Tong Z*.MicroRNA-122-5p regulates coagulation and inflammation through MASP1 and HO-1 genes.Infect Genet Evol.2022.100.105268.SCI(含SCIE)
• 29. Liang L, Cai Y, Lyu B, Zhang D, Chu S, Jing H, Rahimi K, Tong Z*.Air pollution and hospitalization of patients with idiopathic pulmonary fibrosis in Beijing: a time-series study..Respir Res.2022.23(1).81.SSCI
• 30. Qian Z, Zhang Z, Ma H, Shao S, Kang H, Tong Z*.The efficiency of convalescent plasma in COVID-19 patients: A systematic review and meta-analysis of randomized controlled clinical trials.Front Immunol.2022.13.964398.SCI(含SCIE)
• 31. Chen Y, Liu X, Tong Z*.Mesenchymal Stem Cells in Radiation-Induced Pulmonary Fibrosis: Future Prospects.Cells.2022.12(1).6.SCI(含SCIE)
• 32. Zhao Z, Sun W, Zhao X, Wang X, Lin Y, Zhang S, Li Z, Lu Y, Gong J, Yu Y, Li B, Hu X, Li Y, Tong Z*.Stimulation of both inspiratory plus expiratory muscles versus diaphragm-only paradigm for rehabilitation in severe COPD patients: a randomised controlled pilot study.Eur J Phys Rehabil Med.2022.58(3).487-496.SCI(含SCIE)
• 33. Rong H, Zhang C, Rong G, Li T, Qian X, Wang D, Tong Z*.Analysis of lncRNA and mRNA Repertoires in Lung From BAFF-R-Deficient Pneumocystis-Infected Mice.Front Immunol.2022.13.1664-3224.SCI(含SCIE)
• 34. 中国老年医学会呼吸病学分会,中国康复医疗机构联盟呼吸康复专业委员会，童朝晖*，席家宁*.吸入疗法在呼吸康复中应用吸入疗法在呼吸康复中应用的中国专家共识的中国专家共识.中华结核和呼吸杂志.2022.45(8).753-761.自主认定核心期刊
• 35. 赵智玲, 唐晓, 何蔡为, 刘雅兰，李绪言，王睿，李影，曹偲妤，孙兵，童朝晖*.10例重症鹦鹉热衣原体肺炎合并急性呼吸窘迫综合征的临床特征及预后分析.中华结核和呼吸杂志.2022.45(10).1015-1021.自主认定核心期刊
• 36. Luo L, Li Y, Wang L, Sun B, Tong Z*.Prediction of the short-term and long-term mortality in difficult-to-wean patients by transthoracic echocardiography and diaphragm ultrasound.Chin Med J (Engl).2022.135(13).1604–1606.SCI(含SCIE)
• 37. Lifang Guo*, Xin Wang, Shihui Wang, Linbin Hua, Nan Song*, Bin Hu*, Zhaohui Tong*.Efficacy of immune-checkpoint inhibitors in PD-L1 selected or unselected patients vs. control group in patients with advanced or metastatic urothelial carcinoma.Oncoimmunology.2021.10(1).1887551.SCI(含SCIE)
• 38. Xu-Yan Li, Ming Hu, Rui-Qiang Zheng, Yi-Shan Wang, Han-Yu-Jie Kang, Li Jiang, Ming Zhong, Ling Sang, Xia Zheng, Chun Pan, Wei Zhang, Hai-Bo Qiu*, Bin Du*, Zhao-Hui Tong*.Delayed Initiation of ECMO Is Associated With Poor Outcomes in Patients With Severe COVID-19: A Multicenter Retrospective Cohort Study.Front Med (Lausanne).2021.16(8).716086.SCI(含SCIE)
• 
  
• 主编或副主编的著作/译著：
• 1. 《常用临床研究方案设计与标书撰写技巧》,主编,人民卫生出版社,2023-12
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• 重要奖项：
• 1. 胸腔积液病因学诊断的关键技术及其临床应用
• 2. 胸腔积液的免疫学及诊断学研究
• 3. 严重急性呼吸综合征（SARS）的临床与基础系列研究